23 février 2024

Installation

R doit être installé proprement

Rester à jour : version mineure en cours, ex.: 4.3

version$version.string
## [1] "R version 4.3.2 (2023-10-31)"

Mettre à jour RStudio à chaque mise à jour de R

Référence : Travailler avec R, chapitre 1

Choisir un dossier de travail

Le dossier Home : ~

Toujours travailler dans un projet : File / New Project…

Ne jamais utiliser setwd() pour définir le dossier de travail : c’est toujours celui du projet.

Packages

Les packages étendent les possibilités de R.

Installation depuis un dépôt officiel avec contrôle de qualité : CRAN.

Menu Tools / Install Packages…

Les packages sont installés dans %localappdata%/R/win-library/4.3/ pour R version \(\geq\) 4.3.

RStudio

Installer la dernière version.

Utiliser le codage UTF8 pour tous les fichiers:

  • Menu “File > New File > R Script”,
  • “File > Save with Encoding…”, choisir UTF8,
  • Cocher “Set as default encoding for source files”,
  • Enregistrer puis supprimer le fichier.

Démarrage

Les fenêtres de RStudio

Travailler dans un projet

Créer un projet, y placer tous les fichiers.

Scripts dans le dossier du projet.

Données dans data.

Un fichier par traitement

Ecrire un script dans un projet R, le commenter abondamment.

Utiliser dès que possible des blocs-note RMarkdown.

Utiliser les aides

Aide des fonctions dans R.

Google.

Vignettes des packages.

Echanger le projet complet

Pour collaborer, partager le dossier du projet.

Utiliser dès que possible GitHub.